学院基本机构
教学机构：
生态学系
环境科学系
生态与环境实验教学中心
生态环境样本库
科研机构：
生态学与地植物学研究所
环境科学与生态修复研究所
生态学野外研究工作站
梅里雪山工作工作站
哀牢山生态学研究工作站
晋宁湖泊流域生态研究工作站
牟定森林变迁生态研究工作站
科研基地：
云南省生态建设与可持续发展研究基地
云南省高校高原山地生态与资源环境重点实验室
云南省生物多样性信息中心
云南省西南生物资源保护与利用协同创新中心（共建）
云南生物资源保护与利用国家重点实验室培育基地（共建）
云南省国际河流与跨境生态安全重点实验室（共建）
联合国教科文卫组织生态学教习机构
联合国环境署全球污染植物生物检测网点（IPPB）
人才培养基地：
生态学国家特色专业（2008年～）
环境科学国家特色专业（2010年～）
生命科学国家级实验教学示范中心（联合共建，2008年～）
国家级大学生野外实践基地（联合共建，2011年～）
重点学科：
生态学国家重点学科（2002年～）
生态学省级重点学科（1988年～）
学位点：
生态学研究生招生（1956年）
生态学博士学位点（1989年）
生态学一级学科博士/硕士学位点（2011年）
生态学（一级学科）博士后工作站（2012年）
生物学一级学科博士/硕士学位点（2002年）
科研与教学团队：
高原退化环境与生态修复省创新团队
生态学与环境课程群省级教学团队
管理机构：
院党政办公室
院教务办公室
